大明朝廷内忧外患不断，朝廷内部因王锡爵顺从皇帝朱翊钧奉诏拟旨，提出‘三王并封’：即将长子朱常洛、三子朱常洵、五子朱常诰同时封为藩王，虚太子之位以待。
三王并封旨意一出，举朝哗然。满朝大臣把矛头直指首辅王锡爵，群臣弹劾王锡爵的奏章如雪花般飞至内阁，造成内阁阁臣与六部部臣之间的矛盾日益激化。
王锡爵成为众矢之的，满腔怨言，对吏部文选司郎中顾宪成抱怨道：“当今所最怪者，庙堂之是非，天下必欲反之。”
顾宪成当即反唇相讥道：“吾见天下之是非，庙堂必欲反之耳！”
大明朝中群臣地方官员纷纷反对三王并封，天下舆论更是一片倒指责内阁首辅王锡爵曲意逢迎皇帝旨意，朱翊钧迫于公论压力，不得不取消三王并封。
朱翊钧并未打算顺着天下舆情册立太子，坚持老掉牙的借口‘中宫若无所出，再行册立。’朱翊钧打出的皇后牌让满朝官员不敢再大加指责，大明朝廷内部为国本之争暂时消停下来，但播州叛乱已经出现越演越烈扩大趋势。
四川、云南、湖广、贵州文武请求增兵平定播州叛军的加急奏书雪花般昼夜兼程送至大明朝廷，大明朝廷君臣不得不再次从九镇抽调精兵南下赶往西南地区扭转不利战局。
万历帝朱翊钧格外重视播州杨应龙叛乱，前后共调集了精兵十万，军民二十万，共计三十万大军参与平定播州之乱。明廷派出朝廷鹰派阁臣张位总理节制四川、贵州、云南、湖广、广西五省军务，再次赐尚方剑主持平叛，以太仆寺少卿李化龙为监军。
明廷调陕西前宁夏总兵牛秉忠、甘肃镇参将达云等率宁夏、延绥、甘肃、陕西四镇抽调的两万大军南下四川，命宁夏总兵萧如薰，甘肃总兵王允中、延绥总兵麻贵、陕西镇总兵尤继先等加强防御鞑靼土默特部犯边。
杨应龙率五万播州军横扫四川大江以南各州县，为攻破四川重兵防御的大江（川江）防线，杨应龙下令在播州境内赤水河沿岸、江津县、合江县、纂江县一带打造战船，准备大举进攻四川重兵防守的大江防线。
杨应龙率播州水军六十余艘战船五千水军将士沿大江东进大举进攻重庆府，播州水师战船上配置有八十余门从四川各地缴获的火炮，三万播州军从南岸赶往重庆府城。
坐镇泸州防御的四川都司王之翰得知杨应龙率水陆大军三万余沿大江东进攻打重庆府，忙派人向坐镇叙州府的四川巡抚谭希思禀报，王之翰决定抓住战机忙率百余艘大小战船搭载八千官兵乡勇沿江东下，打算与镇守重庆府的四川总兵刘承嗣夹攻杨应龙大军，一举击败杨应龙。
王之翰率泸州守军沿江东下导致泸州防线兵力空虚，穆照按照杨应龙命令率一万大军战船五十余艘趁机突袭进攻泸州，一举击溃泸州四川守军，攻占泸州城，随即向叙州府境内发起进攻。
江津县城位于大江南岸突出位置，大江在江津县城绕城东西北三面向东流去。王之翰率领八千四川官兵乡勇在城东与突然折返回来的杨应龙三万余水陆大军相遇，王之翰顿时大呼上当：“不好，我们中计了，快撤回泸州。”
杨应龙面对四川重兵防守大江防线难以迅速突破，接受副军师孙时泰建议决定放弃攻打重镇重庆府，寻找薄弱点突破江防直捣兵力空虚的四川后方。
杨应龙一向工于心计，诡计多端，为迷惑驻守泸州的四川都司王之翰，亲率播州水陆大军主力沿江东下，吸引王之翰率兵尾随东下，一心想将功赎罪的王之翰果然中计，穆照趁虚渡江一举攻破泸州城，泸州成为播州军攻入四川腹地的突破口。
四川官兵乡勇纷纷忙着调转船头拼命划桨向西逆流撤退回泸州，悬挂着‘播’字旗号的播州水军阵中一艘高大的斗舰战船桅杆上悬挂着大纛‘杨’字旗号，一身戎装的杨应龙看着拼命划桨撤退的四川官兵嘴角露出一丝诡异笑容下令道：“传令下去，一举歼灭明军。”
“是”随军出征的内司总管田一鹏忙领命传令下去
‘轰轰……’江津城西一阵炮声响起，呼啸袭来的炮弹直扑向城西江面上拼命划桨撤退的四川水军战船，顿时将四川水军战船炸得一片船毁人亡，四川官兵惨呼声不断响起：“啊啊……”
杨应龙在后率播州水军冲杀赶来，看着四川水军遭到炮击后一片船毁人亡，杨应龙欣喜若狂下令道：“都给寡人冲上去，杀光明军。”
田一鹏高呼传令道：“国主有令，冲上去杀光明军。”
“杀……”播州军将士喊杀声震天，纷纷驾船划桨朝着正落荒而逃的四川官兵冲杀上去，王之翰率领的八千四川水师官兵全军覆没，尽数被杀光，尸首顺江东下，江水为之赤红。
江津水战，杨应龙歼灭四川都司王之翰率领的八千大军，以泸州为突破口一举攻入四川腹地，杨应龙率三万水陆大军大举攻入叙州府，坐镇叙州府指挥四川官兵作战的四川巡抚谭希思从未有带兵作战经历，擅长专研理学，面对来势汹汹的播州军进攻吓得忙带着护卫北逃嘉定州（乐山），命参将郭成留守叙州府，郭成面对播州军大举来攻，也弃城北逃。
坐镇省城成都府的川贵总督邢阶得报播州叛军攻破大江防线，正朝成都府城杀来，邢玠于隆庆五年（1571年）三月登进士及第。初授密云知县，后为甘肃巡按、山东右参政、陕西参政兼佥事、陕西按察使，邢阶在甘州练兵时取得土窑、水塘之捷，升右布政使，后任大同巡抚等职。
川贵总督邢玠是亲自领兵上阵杀敌的文武全才，面对播州杨应龙大军来攻，四川将士太过羸弱，邢玠不得不亲自领兵上阵作战，邢玠忙调集一万余四川官兵南下赶到资阳县迎战正大举北上的播州军先锋大将穆照，邢玠凭借着数十门火炮优势一举击败穆照率领的播州军先锋，乘胜南下收复资县、内江，与逃到嘉定州的四川巡抚谭希思、参将郭成击退一万沿岷江大举北上的播州军。
杨应龙派出两路先锋大军北上进攻成都失利败退回来，损兵折将不少，杨应龙亲自统率三万播州水陆大军北上，攻占四川巡抚谭希思、参见郭成防守的嘉定州，谭希思、郭成败逃眉州，播州军沿岷江北上攻占嘉定州，兵锋直指成都。
邢玠面对四川巡抚谭希思接连兵败，自知兵力单薄忙撤退回成都府防守，同时下令四川总兵刘承嗣率一万大军增援成都府。